堡垒、防御栅栏；沿河设立多处明军永久卫所，常年派驻兵马镇守；所有被俘黄金宗室拆分押送关内，分散管控。
此战被俘的鞑靼宗室、牧民共计两万余人，沿用洪武年间安置规制，拆分送往北平、山西、山东各地，分置不同州县，杜绝蒙古人抱团聚集作乱。
朱棣颁布汉文、蒙古文双版谕旨，派人传遍整片草原：瓦剌此战未曾出兵协助鞑靼抵抗王师，朝廷准许瓦剌继续在西疆阿尔泰山一带放牧、与边关互市通商；但凡隶属于黄金家族鞑靼各部，若再南下劫掠中原州县，大明必调集举国兵马再度大举征伐，永不宽宥。
战败消息传到北方荒原，一路逃窜的也速迭儿收拢残兵，麾下势力直接折损大半，依附他的草原万户十去其七；藏匿在贝加尔湖深处的忽必烈嫡系残余势力，听闻克鲁伦河惨败，吓得常年不敢向南踏出半步。瓦剌马哈木借明军重创鞑靼的天赐机会，持续向东蚕食漠北草场，草原瓦剌、鞑靼两方势力强弱彻底反转，阿里不哥后裔执掌的黄金汗庭，再也没有往日威慑四方草原部族的力量。