中计，急令撤军，可归路已被明军死死堵住，前后夹击，清军大乱，自相践踏，尸横遍野。
多尔衮率残部拼死突围，往山海关方向逃窜，行至长城脚下，忽闻身后水声大作，定睛一看，竟是清军此前预埋的水坝被掘开，滔滔洪水顺着山势奔涌而来，直扑明军后队。原来多尔衮早有预谋，暗中命人于长城上游筑坝蓄水，若战事不利，便掘坝水淹明军，妄图同归于尽。
孙兰见洪水骤至，面色沉稳，急令韩破虏率部移往高处，又命士卒搭建浮桥，稳住阵脚。洪水虽冲走部分明军辎重，却未伤及主力，反而将逃窜的清军残部冲散，多尔衮仅带数百亲卫，借着洪水掩护，弃了山海关，仓皇往盛京方向逃去。
驻守山海关的清军残部，见主帅逃亡，洪水肆虐，军心彻底溃散，谭泰见大势已去，率剩余守军开城投降，大明军旗顺利插上山海关城楼，这座天下第一关，终复归汉家所有。
孙兰入驻山海关，安抚降兵，整顿军纪，救治伤卒，随即传令大军休整三日，待水势退去，即刻北上追击多尔衮，直捣盛京。可此时探马来报，蒙古察哈尔部虽与李过结盟，却迟迟不肯出兵，坐观成败；朝鲜王国更是暗中派遣使者，向多尔衮输送粮草军械，助其对抗明军；多尔衮逃至盛京后，又收拢关外满兵两万，死守盛京，凭辽河天险抵御明军。
诸葛牛进言：“大将军，蒙古、朝鲜首鼠两端，若不先收服，我军北伐必受牵制。不如遣使前往察哈尔部，许以厚利，促其出兵夹击盛京；再传檄朝鲜，斥责其暗通胡虏，令其断绝与清军往来，否则待平定辽东，必兴师问罪。”孙兰依计而行，遣使者分赴蒙古、朝鲜，晓以利害。
三日之后，孙兰留五千兵马驻守山海关，亲率七万大军，携郑成功、韩破虏，渡辽河北上，李过率部留守后方，保障粮道。大军行至辽河岸边，对岸清军早已列阵，多尔衮亲登盛京城楼，督战死守，辽河水面宽阔，清军战船密布，严防明军渡河。
孙兰立于河边，观察地形，见上游水流平缓，遂令郑成功率水师佯攻正面，吸引清军注意力，自己则率主力，趁夜于上游浅滩处搭建浮桥，悄悄渡河。夜半时分，明军主力悄然渡过辽河，绕至盛京西侧，天未亮便发起突袭，直扑清军大营。
清军睡梦之中，突遭袭击，毫无防备，大营瞬间被攻破，死伤无数。多尔衮在盛京宫中听闻明军已渡辽河，攻至城下，大惊失色，急令关闭城门，死守城池。明军将盛京团团围住，日夜猛攻，火铳、火炮轮番轰击，盛京城墙多处崩塌，清
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